Trahi par le Docteur Morisaki, Shin poursuit son voyage afin de ressusciter Shun, son frère. Perdu au beau milieu des ruines, il se fait rapidement cerner par les Yi, des créatures de l'ombre.

C'est alors qu'il est sauvé par un habitant des environs qui a l'air d'en savoir beaucoup sur « le retour à la vie »...

L'histoire alternative de Voyage vers Agartha, la toute dernière oeuvre de Makoto Shinkai, trouve ici son dénouement !